Moravskoslezská fotbalová liga

Tomáš Matoušek udělal své první fotbalové krůčky v Morkovicích, už v žákovských kategoriích ale zamířil do Kroměříže. V létě 2011 opustil Hanáckou Slavii – nejprve formou hostování, později přestoupil do Třince. V jeho dresu si zahrál druhou ligu a jako obránce se v ní dokázal dvakrát střelecky prosadit. Po čtyřech letech se v létě 2015 vrátil natrvalo do Kroměříže. Ambiciózní celek však nenaplnil očekávání a Matoušek zamířil na hostování do sousedního Hulína. Ve Spartaku si rychle vybojoval místo v základní sestavě na pozici pravého obránce a výrazně přispěl k historicky nejvyššímu bodovému zisku klubu v MSFL.

V průběhu sezony 2016/2017 se vrátil zpět do Kroměříže, kde pomohl týmu po nepovedeném podzimu vyšplhat až na konečné čtvrté místo. Postupně se stal jednou z hlavních opor obrany i kapitánem mužstva. Vrchol svého působení v Hanácké Slavii zažil v sezoně 2022/2023, kdy s týmem vybojoval postup do Fotbalové národní ligy. Kroměříž však ve druhé nejvyšší soutěži vydržela pouze jednu sezonu. Po návratu do MSFL přišel další úspěch – okamžitý návrat do vyšší soutěže. Zároveň šlo o poslední sezonu Tomáše Matouška v dresu Hanácké Slavie.

Po postupu přestoupil do ČSK Uherský Brod, který naopak ve stejné sezoně z MSFL sestoupil. V ročníku 2026/2027 se ale zkušený obránce do třetí nejvyšší soutěže vrací už v dresu Uherského Brodu, se kterým s přehledem vyhrál divizní skupinu.

Ve druhé lize odehrál Tomáš Matoušek 66 utkání a vstřelil 2 branky.