| 01.08.2025 | 1. kolo | FC Sparta Brno 3-4 FK Maraton Pelhřimov | 90' |  | | | |
| 09.08.2025 | 2. kolo | FK Maraton Pelhřimov 2-1 FC Havlíčkův Brod | 90' | | | | |
| 17.08.2025 | 3. kolo | FC ŽĎAS Žďár nad Sázavou 1-1 FK Maraton Pelhřimov | 90' | | | | |
| 24.08.2025 | 4. kolo | FK Maraton Pelhřimov 0-3 FC Velké Meziříčí | 90' | | | | |
| 31.08.2025 | 5. kolo | SK Tatran Ždírec nad Doubravou 4-2 FK Maraton Pelhřimov | 90' | | | | |
| 13.09.2025 | 7. kolo | AFC Humpolec 0-1 FK Maraton Pelhřimov | 3' | | | | |
| 21.09.2025 | 8. kolo | FK Maraton Pelhřimov 0-5 FC Velká Bíteš | 69' | | | | |
| 05.10.2025 | 10. kolo | FK Maraton Pelhřimov 1-0 1. SC Znojmo FK | 4' | | | | |
| 19.10.2025 | 12. kolo | FK Maraton Pelhřimov 1-1 FC Kuřim | 5' | | | | |
| 08.11.2025 | 15. kolo | TJ Sokol Tasovice 2-4 FK Maraton Pelhřimov | 2' | | | | |
| 08.03.2026 | 16. kolo | FK Maraton Pelhřimov 3-1 FC Sparta Brno | 90' | | | |  |
| 14.03.2026 | 17. kolo | FC Havlíčkův Brod 1-1 FK Maraton Pelhřimov | 90' | | | | |
| 22.03.2026 | 18. kolo | FK Maraton Pelhřimov 2-1 FC ŽĎAS Žďár nad Sázavou | 57' | | | | |
| 29.03.2026 | 19. kolo | FC Velké Meziříčí 2-2 FK Maraton Pelhřimov | 18' | | | | |
