| 24.08.2025 | 4. kolo | FK Maraton Pelhřimov 0-3 FC Velké Meziříčí | 15' |  | | | |
| 31.08.2025 | 5. kolo | SK Tatran Ždírec nad Doubravou 4-2 FK Maraton Pelhřimov | 14' | | | | |
| 07.09.2025 | 6. kolo | FK Maraton Pelhřimov 0-2 SK Artis Brno B | 27' | | | | |
| 21.09.2025 | 8. kolo | FK Maraton Pelhřimov 0-5 FC Velká Bíteš | 19' | | | | |
| 05.10.2025 | 10. kolo | FK Maraton Pelhřimov 1-0 1. SC Znojmo FK | 1' | | | | |
| 29.10.2025 | 9. kolo | TJ Tatran Bohunice 1-0 FK Maraton Pelhřimov | 25' | | | | |
| 02.11.2025 | 14. kolo | FK Maraton Pelhřimov 5-2 FC Chotěboř | 5' | | | | |
| 08.11.2025 | 15. kolo | TJ Sokol Tasovice 2-4 FK Maraton Pelhřimov | 1' | | | | |
| 08.03.2026 | 16. kolo | FK Maraton Pelhřimov 3-1 FC Sparta Brno | 9' | | | | |
| 14.03.2026 | 17. kolo | FC Havlíčkův Brod 1-1 FK Maraton Pelhřimov | 7' | | | | |
| 22.03.2026 | 18. kolo | FK Maraton Pelhřimov 2-1 FC ŽĎAS Žďár nad Sázavou | 13' | | | | |
| 03.04.2026 | 20. kolo | FK Maraton Pelhřimov 3-3 SK Tatran Ždírec nad Doubravou | 22' | | | | |
| 12.04.2026 | 21. kolo | SK Artis Brno B 3-1 FK Maraton Pelhřimov | 6' | | | | |
| 19.04.2026 | 22. kolo | FK Maraton Pelhřimov 1-1 AFC Humpolec | 27' | | | | |
| 25.04.2026 | 23. kolo | FC Velká Bíteš 4-1 FK Maraton Pelhřimov | 45' | | | | |
| 01.05.2026 | 24. kolo | FK Maraton Pelhřimov 0-1 TJ Tatran Bohunice | 27' | | | | |
| 10.05.2026 | 25. kolo | 1. SC Znojmo FK 4-0 FK Maraton Pelhřimov | 45' | | | | |
| 17.05.2026 | 26. kolo | FK Maraton Pelhřimov 5-2 SK Fotbalová škola Třebíč | 6' | | | | |
| 31.05.2026 | 28. kolo | FK Maraton Pelhřimov 3-0 TJ Dálnice Speřice | 9' | | | | |
| 06.06.2026 | 29. kolo | FC Chotěboř 1-2 FK Maraton Pelhřimov | 17' | | | | |
| 12.06.2026 | 30. kolo | FK Maraton Pelhřimov 1-2 TJ Sokol Tasovice | 45' | | | | |
